POLNUSTAR memiliki lambang yang didalamnya terdapat tulisan POLITEKNIK NEGERI NUSA UTARA diatas pita berwarna merah, 1 (satu) bintang berbentuk segi lima berwarna kuning, 2 (dua) ekor ikan yang saling berhadapan berwarna biru laut , 1 (satu) mata pena berwarna kuning , 1 (satu) ekor ular yang melingkar dimata pena berwarna putih dan 3 (tiga ) garis gelombang biru laut

MAKNA :
A. BINTANG berbentuk segi lima, melambangkan pancasila sebagai Dasar Negara Pancasila
B. 2 (DUA) EKOR IKAN yang berhadapan membentuk bola dunia melambangkan visi dan misi POLNUSTAR yang berorientasi kebaharian dan berwawasan global
C. 3 (TIGA) GARIS GELOMBANG, melambangkan ciri khas daerah bahari yang didalamnya ada pulau-pulau, Yakni Kepulauan Sangihe, Talaud dan Sitaro/
D.MATA PENA yang terintegerasi dengan antena , melambangkan penguasaan dan penerapan ilmu dan teknologi informasi seecara regional dan global.
E. ULAR BERWARNA PUTIH, melambangkan prinsip pengobatan biang kesehatan